Die Quitten unter fliessendem Wasser waschen und mit einem Küchenschwamm den Flaum entfernen. Den Stiel und den Blütenansatz grosszügig abschneiden. Die Quitten vierteln, das Kerngehäuse entfernen (und zwar komplett, so dass auch keine weissen Ränder des Kerngehäuses übrig bleiben) und in Stücke schneiden.
Die Äpfel waschen, entkernen und ebenfalls in Stücke schneiden.
Das Wasser in einen grossen Topf geben und auf den Herd stellen. Äpfel, Quitten und Thymian hinzugeben und ca. 45 Minuten auf mittlerer Hitze köcheln lassen.
Die Mischung mit einem Stabmixer pürieren. Den Zitronensaft, den Gelierzucker und nach Belieben das Mark einer Vanilleschote dazugeben.
Die Konfitüre aufkochen, 4 Minuten köcheln lassen und in sterilisierte Gläser abfüllen.